Ο Κώστας Φωτάκης είναι Αναπληρωτής Υπουργός Έρευνας και Καινοτομίας του Υπουργείου Πολιτισμού, Παιδείας και Θρησκευμάτων (ΥΠΟΠΑΙΘ) και Καθηγητής Φυσικής του Πανεπιστημίου Κρήτης.
• Από το 2011 Πρόεδρος του Ιδρύματος Τεχνολογίας και Έρευνας (ΙΤΕ)
• 1997-2013 Διευθυντής του Ινστιτούτου Ηλεκτρονικής Δομής και Λέιζερ (ΙΗΔΛ) του ΙΤΕ
• 7/2012-12/2013 Συντονιστής της Συνόδου των Προέδρων των Ερευνητικών Κέντρων
• Διευθυντής της Ευρωπαϊκής Εγκατάστασης Λέιζερ (ΙΤΕ)
• Μέλος Εθνικών και Ευρωπαϊκών Επιτροπών εμπειρογνωμόνων για θέματα επιστημονικής πολιτικής όπως το ESFRI
• Συμμετοχή στην Ομάδα της Ε.Ε. που αξιολόγησε το Πρόγραμμα Ευρωπαϊκών Ερευνητικών Υποδομών
• Πρόεδρος της Συμβουλευτικής Ομάδας της Ε.Ε. για τις Ερευνητικές Υποδομές 2012-2015 και Πρόεδρος της Ομάδας Εμπειρογνωμόνων για τον ρόλο των Πανεπιστημίων και Ερευνητικών Οργανισμών στη στρατηγική της «Έξυπνης Εξειδίκευσης» για την Περιφερειακή Ανάπτυξη.
Ερευνητικά Ενδιαφέροντα: Φωτονική (Photonics) και Φασματοσκοπία Λέιζερ. Πάνω από 300 δημοσιεύσεις και 6000 αναφορές. Μέλος διεθνών επιστημονικών επιτροπών συνεδρίων. Εκδότης ή συν-εκδότης διεθνών επιστημονικών περιοδικών και τεσσάρων επιστημονικών βιβλίων παγκόσμιας κυκλοφορίας.
Διακρίσεις: «Βραβείο Ηγεσίας» (2004) της Αμερικανικής Εταιρείας Οπτικής (OSA) 2005-6 Springer Professor στο Πανεπιστήμιο Καλιφόρνιας, Μπέρκλεϋ.2010 Επίτιμος Διδάκτωρ του Πανεπιστημίου της Μασσαλίας.Ισόβιο μέλος και Fellow της OSA.