Ο Σπύρος Φιλιώτης έχει πάνω από 15 χρόνια εμπειρίας στη φαρμακευτική βιομηχανία. Κατέχει τις θέσεις του Αντιπροέδρου και Γενικού Διευθυντή της Pharmaserve - Lilly ΑΕΒΕ (από τον Ιανουάριο του 2010), του Αντιπροέδρου και Υπεύθυνου Κλινικής Έρευνας του Ελληνικού Συνδέσμου Φαρμακευτικών Επιχειρήσεων Ελλάδος (ΣΦΕΕ), καθώς επίσης του Ταμία και μέλους του Διοικητικού Συμβουλίου στο Φόρουμ Φαρμακευτικής Καινοτομίας (PIF).

Ξεκίνησε την καριέρα του στη φαρμακευτική αγορά το 1997 στην Eli Lilly and Company στην Ινδιανάπολη των Η.Π.Α, την οποία και συνέχισε στην Lilly Ισπανίας. Μετά την ολοκλήρωση της στρατιωτικής του θητείας εντάχθηκε, το 2001, στην Pharmaserve-Lilly ως Επιστημονικός Συνεργάτης. Διετέλεσε μεταξύ άλλων Διευθυντής Διαχείρισης Τομέων, καθώς και Διευθυντής Εταιρικών και Κοινωνικών Υποθέσεων. Το 2008, επέστρεψε στην Ινδιανάπολη συμμετέχοντας στην ομάδα του διαβήτη στην Lilly. Λίγους μήνες αργότερα ανέλαβε καθήκοντα Γενικού Διευθυντή στην Lilly Denmark.